2005年12月25日，上海海港俱乐部的前身上海东亚俱乐部正式成立。2006年，上海东亚首次参加职业联赛，2007年获中乙联赛冠军，2012年升入中超联赛。

　　2014年年底，上海上港集团正式入主，俱乐部也改名为上海上港。2018赛季，上海上港提前一轮问鼎中超联赛冠军，这也是俱乐部成立以来的首个联赛冠军奖杯。

　　2021年初，上海上港俱乐部更名为上海海港俱乐部。2023赛季，俱乐部获得了队史上第二座中超联赛冠军奖杯。

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